1、圖象攝取

　　凝膠成像系統(tǒng)采用數(shù)碼攝影將攝取的圖象直接輸入計算機系統(tǒng)。在暗箱中的紫外燈照射下，通過調(diào)節(jié)變焦光圈、變焦倍數(shù)及焦距使樣品清晰及大小適當(dāng)。圖象攝取獲得以后，通過圖象處理軟件軟件中圖象處理菜單的“亮度”和“優(yōu)化”項進行亮度調(diào)整和圖象優(yōu)化，以降低圖象本底噪聲。

　　凝膠成像系統(tǒng)經(jīng)過這樣處理以后能得到清晰的凝膠圖片，同時在圖象中加入文字信息進行適當(dāng)注釋，用熱敏打印機或現(xiàn)在常用的高品質(zhì)照片級噴墨打印機打印以后，可以得到符合文章發(fā)表要求的照片打印。

　　2、分子量定量

　　對于一般常用的DNA膠片，利用凝膠成像系統(tǒng)的圖象處理軟件中分子量定量功能，通過對膠上DNAMarker條帶的已知分子量注釋，自動生成擬合曲線，并以它衡量得到未知條帶的分子量。通過這種方法所得到的結(jié)果較肉眼觀察估計要準(zhǔn)確很多。

　　3、密度定量

　　一般常用的測定DNA(脫氧核糖核酸)和RNA(核糖核酸)濃度的方法是紫外吸收法，但它只能測定樣品中的總核苷酸濃度，而不能區(qū)分各個長度片段的濃度。但利用凝膠成像系統(tǒng)和圖象處理軟件軟件，對于DNA膠片上某一已知其DNA含量的標(biāo)準(zhǔn)條帶，在調(diào)節(jié)閥值和積分框并進行密度標(biāo)定以后，可以方便的單擊其他未知條帶根據(jù)其光密度值得到其DNA含量。

　　凝膠成像系統(tǒng)比紫外吸收法方便，可以測出不同長度的片段的含量，而所得結(jié)果對于分子生物學(xué)操作要求的準(zhǔn)確度是足夠的。值得指出的是，凝膠成像系統(tǒng)也適用于對PAGE蛋白膠條帶的濃度測定。

　　4、密度掃描

　　在分子生物學(xué)和生物工程研究中，常用到的是對蛋白表達產(chǎn)物占整個菌體蛋白的百分含量的計算。傳統(tǒng)的方法是利用的密度掃描，但利用生物分析軟件結(jié)合現(xiàn)在實驗室常規(guī)配備的掃描儀或者直接用白光照射的凝膠成像系統(tǒng)就能完成此項工作。

　　選擇凝膠成像系統(tǒng)的密度掃描命令，可以將代表某一微生物菌株的泳道圖象用虛線框住以后，即可得到對此區(qū)域的縱向掃描曲線圖。一般選擇自動積分選項可以自動計算出對應(yīng)于各個膠帶的每個峰面積相對于整個曲線所占的百分比，也可以選手動積分，人工選擇積分區(qū)域，對于某些條帶較弱，本底較高的圖譜可以進行基線調(diào)整，在誤差的允許范圍內(nèi)得到更佳的實驗結(jié)果。

　　5、PCR定量

　　PCR定量主要是指，當(dāng)做PCR實驗時如果擴增出來的條帶不是一條時，利用此命令可以計算出各個條帶占總體的相對百分?jǐn)?shù)，凝膠成像系統(tǒng)這個功能與密度掃描類似，但實際在原理上并不相同。PCR定量并不對選擇區(qū)域生成縱向掃描曲線圖并積分，而是對選定的幾條帶進行相對密度定量并計算其占總和的百分?jǐn)?shù)。

　　凝膠成像系統(tǒng)在分子生物學(xué)和生物工程研究中幾乎每天都要遇到的研究工作中所具有的功能，由于結(jié)合生物處理軟件可以覆蓋現(xiàn)代生物科學(xué)日常研究的各個領(lǐng)域并能夠取代某些實驗設(shè)備，凝膠成像系統(tǒng)應(yīng)該是現(xiàn)代分子生物學(xué)和其他生物科學(xué)實驗室的常備儀器，不僅如此，它也能用于醫(yī)學(xué)臨床檢驗。